Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1153241	1153242	2	53 [0]	[0] 51	spy	envelope stress induced periplasmic protein

TCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGT  >  minE/1153243‑1153283 |                                         tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAggct  <  1:3564750/41‑3 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:333753/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2565442/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2648189/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2819616/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2832424/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:286854/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2977247/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2993879/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:3065079/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:3089334/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:3112909/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:3173495/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:3250999/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:253592/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:3452297/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:352330/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:3638425/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:383707/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:402276/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:415256/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:435233/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:501303/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:52279/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:950549/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:991279/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1727770/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:106708/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1086240/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1131099/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1145232/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1208956/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1272977/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1320445/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1345113/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1409477/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1455135/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1546556/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:16627/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1052407/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:177321/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1813614/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1931820/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1940882/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:1946460/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:205189/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2065175/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2098924/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2416896/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2455347/41‑1 (MQ=255) tCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGt  <  1:2502334/41‑1 (MQ=255) |                                         TCTGCGGCATGGGCCAGGTTAGCCGCGCCAAGAGCCAGGGT  >  minE/1153243‑1153283

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑