Missing coverage evidence...
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AACGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGAA  >  minE/1154543‑1154604 |                                                              aaCGCCGTTGATTTCTCTCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1246265/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:2400821/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:963230/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:9598/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:84205/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:75895/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:650519/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:6216/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:419561/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:407431/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:403873/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:3058886/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:3046364/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:2798988/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:2531839/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1103171/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:2290302/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:2079045/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:207500/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:2015798/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1964232/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1890294/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1384579/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1357785/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1324676/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1246334/62‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGaa  <  1:1228197/62‑1 (MQ=255) |                                                              AACGCCGTTGATTTCTCGCTCGGTGATAACCGGTTTTTTACCCGTTAAGGTCAGAGCAAGAA  >  minE/1154543‑1154604

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑