Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1161131	1161192	62	41 [0]	[0] 35	ydjX	predicted inner membrane protein

CCACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCT  >  minE/1161193‑1161249 |                                                         ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTGTAGCCTCTATATTCt  <  1:2167058/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:3341951/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2703475/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2725758/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:279779/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:3094427/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:3168960/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:323002/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:3248905/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:3256757/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2678014/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:42654/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:584193/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:620512/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:63832/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:707400/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:844389/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:846681/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:22517/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:1066031/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:1113596/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:1248545/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:1582800/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:1817751/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:1848643/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:1876697/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2173100/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2689851/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2398238/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2490311/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2490685/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2545374/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:259819/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:2663573/57‑1 (MQ=255) ccACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCt  <  1:1013258/57‑1 (MQ=255) |                                                         CCACTTACAGACACTCATCCGCCAGAGCGGATTTTTCGGCTATAGCCTCTATATTCT  >  minE/1161193‑1161249

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑