Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1161796	1161816	21	45 [0]	[0] 62	[ydjX]–[ydjY]	[ydjX],[ydjY]

ATTATTCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCTT  >  minE/1161817‑1161878 |                                                              attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGTGCtt  <  1:1786732/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:3422061/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2501379/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2557918/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2598951/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2744082/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:275393/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:279347/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2811216/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:285659/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2905742/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2973896/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2989220/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:3031955/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:3080955/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:3350963/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2483433/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:3491148/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:3564434/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:3575871/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:437724/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:474443/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:621882/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:67555/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:687923/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:710955/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:808608/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:866616/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:869026/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:890776/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:940852/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:988486/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:157641/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1025898/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1087626/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:119938/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1207184/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1211757/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1223826/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1286545/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1381958/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1416419/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1430369/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1469575/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1509444/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1535704/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1550339/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1021794/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1590252/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1606808/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1628477/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1675833/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1922142/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:1966928/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2020624/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2316783/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2324951/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2332220/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2409559/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2445702/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2458230/62‑1 (MQ=255) attattCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCtt  <  1:2479317/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATTATTCAGTGTCATGGAAAAAAGGACTGGCTGCACTCTGTTTACTGGCTGTTGCTGGGCTT  >  minE/1161817‑1161878

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑