Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1163592	1163632	41	22 [0]	[0] 48	ynjA	conserved hypothetical protein

ACGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGTTT  >  minE/1163633‑1163693 |                                                             aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGATGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:3463681/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGTCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:725736/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:3487842/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1175188/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2886834/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:297320/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:3014544/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:3093847/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:3114144/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:3140538/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:3164657/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:317661/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:3237790/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2876420/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:363024/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:399491/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:43410/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:452139/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:54695/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:558305/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:644988/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:646408/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:651789/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:943965/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1634947/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1368869/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1397256/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1398832/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1441973/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1489735/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1492126/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1498596/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1501880/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1513947/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1604783/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2772919/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1687419/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:1925299/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2122500/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2151531/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2151608/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2179398/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2419713/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2580145/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2661895/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:2750784/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGgtt  <  1:1692912/61‑1 (MQ=255) aCGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCAGCAAAATCTGTCAGCCCGttt  <  1:604546/61‑1 (MQ=255) |                                                             ACGCTCAGGCGCTCACCGAACTGACGGCATTGATCGGCCTGCAAAATCTGTCAGCCCGTTT  >  minE/1163633‑1163693

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑