Missing coverage evidence...
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TCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTAT  >  minE/1168069‑1168141            |                                                              tCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAg               <  1:326090/60‑1 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:2368159/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:805593/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:638407/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:53688/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:527173/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:376116/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:3399285/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:2440900/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:1069624/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:2298923/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:168650/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:1197971/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:1333014/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:1403775/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:1667560/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:2182080/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:181682/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:2003310/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCtat  >  1:2181720/1‑62 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:2689070/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:2777573/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:2892222/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:1731204/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:3534777/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:364173/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:1685315/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:514673/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:2338828/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:2310252/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:697967/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCta   >  1:2218531/1‑61 (MQ=255)            cATCGCTGGTGAGCATTCGATCGTCGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAg      >  1:739797/1‑58 (MQ=255)            |                                                              TCGCCAGGATGCATCGCTGGTGAGCATTCGTTCGTGGCCAGAATTTATCGGTACGACCAGCGGTTACAGCTAT  >  minE/1168069‑1168141

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑