Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1174316	1174387	72	28 [0]	[0] 79	topB	DNA topoisomerase III

GATGACGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAC  >  minE/1174388‑1174436 |                                                 gatgcCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1956699/1‑49 (MQ=255) gatgaGGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3509774/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAGGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2252271/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCa   >  1:2495433/1‑48 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCa   >  1:2221917/1‑48 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2951442/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3269464/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3223261/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3157142/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3135838/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:312383/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3095532/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3009801/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2997452/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3311577/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2861455/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2792105/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2744604/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2645510/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2617745/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2584946/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2517203/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3625875/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:987799/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:968309/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:894444/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:82/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:747756/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:63775/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:587915/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:510948/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:402450/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2488741/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3606024/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3597173/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3462804/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3401850/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3364107/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:336216/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3345878/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:3318927/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:331422/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:142357/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1635777/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1619434/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1616917/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1608537/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1539005/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1504033/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:146209/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1446753/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:17048/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1372814/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1358793/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:133960/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1327260/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1215476/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1208071/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1098152/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1047386/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2107867/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1007615/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2470377/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2312517/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2284157/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:228183/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2266772/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2193419/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2169877/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2126695/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2507104/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:2021256/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1968543/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1856467/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1855956/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:183417/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:176299/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAc  >  1:1756155/1‑49 (MQ=255) gatgaCGTTAAGTTGTTTGGTCACCGAGGGTCGGGGCTGTAATTTCCAc  >  1:1503237/1‑49 (MQ=255) |                                                 GATGACGTTAAGTTGTTTGGTCACGGAGGGTCGGGGCTGTAATTGCCAC  >  minE/1174388‑1174436

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑