Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1176523	1176559	37	15 [0]	[0] 27	[sppA]	[sppA]

TTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTA  >  minE/1176560‑1176621 |                                                              ttttTAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:662447/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2507087/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:881260/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:731991/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:658154/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:59261/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:41748/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:3554218/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:3413408/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:3387608/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:3378832/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2796490/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2641642/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2517470/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:1068855/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2467556/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2186508/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2112345/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2057355/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:2032881/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:1999419/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:1926788/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:18030/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:1643461/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:1355000/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:1158334/62‑1 (MQ=255) ttttAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTa  <  1:1133697/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTTAAATGGACGTGGCGTCTGCTGAATTTCGTCCGTGAAATGGTACTTAACCTGTTCTTTA  >  minE/1176560‑1176621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑