Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1207777	1207784	8	51 [0]	[0] 47	manY	mannose‑specific enzyme IIC component of PTS

ACGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGAAAAAA  >  minE/1207785‑1207846 |                                                              aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCaa                    >  1:586018/1‑44 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAAc                  >  1:1426246/1‑46 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACt                 >  1:1924591/1‑47 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTaccac            >  1:14859/1‑52 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:454652/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:286556/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:3194948/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:3239266/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:3321509/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:3325583/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:3331741/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:3465005/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:3625182/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:3642085/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:398126/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:408161/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:2514239/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:472810/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:518715/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:548350/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:592211/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:654271/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:873724/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:900695/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:990473/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1722226/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1064397/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1099439/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1147312/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1240902/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1302621/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1350033/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1363480/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1373466/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1510780/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1678522/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:2635007/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:176130/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1823879/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1893502/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:217465/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:2183084/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:2446760/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:245791/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:1051545/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaaa  >  1:2611621/1‑62 (MQ=255) aCGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGaaaaa   >  1:1928875/1‑61 (MQ=255) |                                                              ACGAACTGGACTAACAGGTGAGCGAAATGGTTGATACAACTCAAACTACCACCGAGAAAAAA  >  minE/1207785‑1207846

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑