Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1234546	1234551	6	26 [0]	[0] 53	yebG	conserved hypothetical protein regulated by LexA

GCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCTTTTT  >  minE/1234552‑1234600 |                                                 gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCTGCTTCCttttt  <  1:1708715/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2636303/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:251079/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2762226/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2772222/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2832796/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2854508/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2863182/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2914140/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3008575/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3069040/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3121356/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3180610/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3236700/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3237749/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3354770/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3399617/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3578282/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:3591942/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:366399/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:424856/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:55318/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:640365/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:797739/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:842221/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:913059/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:917756/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1811227/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1004086/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1009669/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1073774/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1129155/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1138766/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1267384/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1310572/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1439463/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1606305/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1609336/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1617439/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1618933/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2613205/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1816414/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2055893/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2099792/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2119763/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2217692/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2295800/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2298470/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2360912/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2493719/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:2494471/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCttttt  <  1:1003134/49‑1 (MQ=255) gCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCAGCGGCTTCCttttt  <  1:2424084/49‑1 (MQ=255) |                                                 GCAGATCCGCCGTATCAAGCATTTTGTCATAAGCATCGGCTTCCTTTTT  >  minE/1234552‑1234600

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑