Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1242786	1242944	159	12 [0]	[0] 45	pykA	pyruvate kinase II

CAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTATT  >  minE/1242945‑1242992 |                                                cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3388554/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2166352/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2260466/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2335822/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2519214/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2579037/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3037330/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3041273/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3286721/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3318242/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3344355/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:337816/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2163789/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3407016/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3449907/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3572625/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:358215/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:3641619/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:411663/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:503344/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:557136/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:704581/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:912345/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:164655/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1251050/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1306779/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1362851/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1397357/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1429143/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1431565/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1502133/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1503932/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1523583/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1595991/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1045546/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1667906/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1844242/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1885584/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1897370/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1929029/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1932916/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:1945165/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2003348/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2111028/48‑1 (MQ=255) cAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTAtt  <  1:2140398/48‑1 (MQ=255) |                                                CAGGGCGACGTGATGAGTACCGTGGGTTCTACTAATACCACGCGTATT  >  minE/1242945‑1242992

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑