Missing coverage evidence...
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ACACTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCG  >  minE/1271532‑1271593 |                                                              acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGTGAAGTGAACCAGCg  >  1:369785/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:3465577/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1016206/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2604120/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2717634/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2837981/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2949919/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2961841/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:327694/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:3370225/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:3421441/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:3432404/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:3449282/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2569028/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:3534732/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:3538927/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:455193/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:45808/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:60690/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:639915/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:669433/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:876037/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:880962/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1782341/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1064133/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1184411/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1241713/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1307789/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1315976/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:154087/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1583611/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1590187/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1717002/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1755733/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2533862/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1845041/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1961564/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:1978932/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2079164/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2313836/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2341530/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2401485/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2443595/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2472840/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:2513679/1‑62 (MQ=255) acacTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGGGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCg  >  1:3639547/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACACTGACGGTAACCTGCGGTTCAGTATTGCTGGCGTGTTCCGGTTGCGAAGTGAACCAGCG  >  minE/1271532‑1271593

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑