Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1291939	1292011	73	19 [0]	[0] 89	yeeO	predicted multidrug efflux system

CGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAACGCG  >  minE/1292012‑1292072 |                                                             cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCa              <  1:1685203/49‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2858784/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:487473/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2269974/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:232945/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:391065/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2383694/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2394856/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2428165/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:388391/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2431332/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3627770/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3523581/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:350694/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2667389/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2676832/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2016727/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2977457/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2997384/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3493918/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3024206/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3050178/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3152501/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3189733/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3196443/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3216933/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3468609/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3269941/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3294962/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3306146/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:3331850/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:954201/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1635677/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:817134/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1629749/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1609293/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1599574/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1471769/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:843950/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1436787/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1671081/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:95477/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1285486/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1221684/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1220153/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1166776/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1029939/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1042219/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1689077/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:567764/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1950884/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1931145/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1916441/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:620290/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1848472/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1752588/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:1747855/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:773489/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:790354/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAAt            <  1:2000389/51‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:572253/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:3499305/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:438338/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:3507947/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:999384/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:516994/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2031224/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1114196/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1321814/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1379044/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1451586/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1634523/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1725975/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1734503/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1869627/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1876070/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:1963553/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2010337/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:326543/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2315328/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2378837/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2430537/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2471564/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2514217/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2534752/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2547389/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:2963954/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:3013805/61‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCCGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAAcgcg  <  1:3559111/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGTAGAAGCAGAGCCGAGCGCACTTCCGGGTAAGTTGATAAGAGCCGCAATTGAAAACGCG  >  minE/1292012‑1292072

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑