Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1312149	1312231	83	33 [0]	[0] 35	hisD	bifunctional histidinal dehydrogenase and histidinol dehydrogenase

ACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCA  >  minE/1312232‑1312273 |                                          aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:3405152/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2836423/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2881890/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2923881/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2976516/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:3012064/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:3121962/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:3212028/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:332637/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2775658/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:3542881/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:558253/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:56265/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:566113/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:654567/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:772051/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:821904/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:878440/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2009741/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:1181745/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:1334145/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:152594/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:1581132/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:1601362/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:16772/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:1685369/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:1825328/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:1176491/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2129299/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:248110/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2484642/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2624297/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2659514/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2706905/42‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCa  <  1:2771537/42‑1 (MQ=255) |                                          ACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCA  >  minE/1312232‑1312273

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑