Missing coverage evidence...
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TATCTATGGGTCTGGGTCCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTG  >  minE/108334‑108383       |                                            tctCTATGGGTCTGGGTCCGTTTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2207027/48‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCTTg  <  1:6447/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:3190028/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:235842/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2487007/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:249748/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2532314/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2583320/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2825631/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2928370/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2941979/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2992392/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:3011614/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2348564/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:3259504/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:3401866/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:3430527/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:3520095/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:42670/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:672950/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:908260/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:915855/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:982049/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1534044/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1032333/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1119196/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1206208/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1294980/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1306280/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1311254/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1359991/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:144179/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:148353/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1505858/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:100803/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1719637/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1784128/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1856959/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1887354/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1927929/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1973618/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1977553/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:1983860/44‑1 (MQ=255)       tgggtctgggtcCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTg  <  1:2119558/44‑1 (MQ=255)       |                                            TATCTATGGGTCTGGGTCCGATTGGTGCTATTTACCAGGCTAAATTCCTG  >  minE/108334‑108383

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑