Missing coverage evidence...
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TCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATC  >  minE/1332087‑1332148 |                                                              tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:761987/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2923692/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2964613/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:32645/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:418781/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:455217/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:551964/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:602684/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:759557/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2906676/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:800530/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:825555/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:874009/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:898434/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:90030/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:916884/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:99291/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:1120220/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2888505/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2831683/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2661069/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2552509/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2333489/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2312720/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2230786/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2134012/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:204553/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:2043295/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:1590833/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:1475268/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:1472353/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:1274924/62‑1 (MQ=255) tCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATc  <  1:1185581/62‑1 (MQ=255) |                                                              TCCTGTACCGCGTTACGGTCGGCAATCAGCACCGCATCTTTGGTCTGCACCACTACCAGATC  >  minE/1332087‑1332148

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑