Missing coverage evidence...
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AAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCA  >  minE/1397663‑1397724 |                                                              aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:3526654/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:2614526/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:2934902/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:310725/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:3243581/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:3288925/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:3346723/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:3472838/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:3520624/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:2487877/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:3534988/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:3559791/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:530054/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:543378/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:653286/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:787465/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:879879/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:983435/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1686694/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1020901/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1103316/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1228287/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1307839/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1418365/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1517917/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1648359/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1649401/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1006975/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1777695/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:1894936/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:2130141/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:2171966/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:2263969/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:2324450/62‑1 (MQ=255) aaGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCa  <  1:238287/62‑1 (MQ=255) |                                                              AAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCA  >  minE/1397663‑1397724

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑