Missing coverage evidence...
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TTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGC  >  minE/1399460‑1399521 |                                                              ttAATTGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1798463/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTTGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1412126/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:2868797/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:980208/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:973864/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:903658/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:843179/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:448269/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:3328280/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:329864/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:3295791/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:3144663/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:3099713/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:3092879/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:3074459/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:2907951/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1339838/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:284041/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:2785570/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:2680719/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:2517046/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1760965/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1681670/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1617307/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1604443/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1564313/62‑1 (MQ=255) ttAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGc  <  1:1410424/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTAATGGTTTACCCATGCAGGTAGGGTTGAATACCTTACTGCGTCAGGGAAAACCAGACCGC  >  minE/1399460‑1399521

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑