Missing coverage evidence...
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ACCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAACTGCT  >  minE/1407533‑1407594 |                                                              aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGTTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:1860862/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCt                             >  1:1024794/1‑35 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGtt                        >  1:1984801/1‑40 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCa                      >  1:902283/1‑42 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCgg           >  1:1812441/1‑53 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:522374/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:3134119/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:314010/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:3152443/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:3168519/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:3366363/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:427591/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:466510/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:2617597/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:638702/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:70780/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:863636/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:938387/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:3046591/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:2739440/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:2594666/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:2408108/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:239129/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:2240101/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:2135242/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:2033009/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:2028985/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:1548016/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:147836/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:141454/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:1343152/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAActgct  >  1:1077049/1‑62 (MQ=255) aCCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACGCGGTGAActgct  >  1:465059/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGGTGAACTGCT  >  minE/1407533‑1407594

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑