Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1410302	1410360	59	90 [0]	[0] 23	bcr	bicyclomycin/multidrug efflux system

CGCCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGTTT  >  minE/1410361‑1410422 |                                                              cgcCAATGCGGCGTACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:452084/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGtc                          >  1:2220659/1‑38 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:892026/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:1020669/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:684382/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:622236/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:614390/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:611479/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:52600/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:424708/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:3604218/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:2964957/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:2773923/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:2185205/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:1954262/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:187155/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:1569511/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:1530112/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:1499254/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:1205870/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGttt  >  1:1085165/1‑62 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGtt   >  1:1983640/1‑61 (MQ=255) cgcCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACAAACAGAAAAACAATGttt  >  1:1572275/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGCCAATGCGGCGGACGAAGCGGCTGTTAAAGATGGTCATCACGAACAGAAAAACAATGTTT  >  minE/1410361‑1410422

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑