Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1411123	1411139	17	70 [1]	[0] 28	bcr	bicyclomycin/multidrug efflux system

AGCAGGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTC  >  minE/1411140‑1411201 |                                                              agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGaa                            >  1:2386619/1‑36 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATg                          >  1:2944052/1‑38 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCt                        >  1:3013009/1‑40 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGtgtggt              >  1:1620713/1‑50 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGggtggt              >  1:1862522/1‑50 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGggtggt              >  1:1656694/1‑50 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCt   >  1:525026/1‑61 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:680445/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:2902376/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:490912/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:412194/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:39428/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:77227/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:3335168/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:3133831/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:799250/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:964629/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:3122847/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:102058/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:2466493/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:2316314/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:2175162/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:198197/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:1901550/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:1557626/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:1490262/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:132546/1‑62 (MQ=255) agcagGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTc  >  1:1267805/1‑62 (MQ=255) |                                                              AGCAGGCCAAGGATAAAAACAATAGCAAACGACGAATGCTGTCGGGTGGTCACAACGGGCTC  >  minE/1411140‑1411201

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑