Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1411480	1411486	7	8 [0]	[0] 25	rsuA	16S rRNA pseudouridylate 516 synthase

ATCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCGG  >  minE/1411487‑1411546 |                                                            aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGAt                           >  1:2735283/1‑35 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGtctt                    >  1:256359/1‑42 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGt                       >  1:147066/1‑39 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATTATGgcgcag  >  1:2273667/1‑58 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGcgcg   >  1:541905/1‑59 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCgggg  >  1:920010/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:2451928/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:99580/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:652031/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:630247/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:367664/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:3480420/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:3479449/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:3434496/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:2741795/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:1305671/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:2437395/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:2292182/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:19811/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:1552200/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:1548055/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:1413718/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:1333006/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:1331395/1‑60 (MQ=255) aTCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCgg  >  1:1324604/1‑60 (MQ=255) |                                                            ATCGTCAGCTACAGGTGATTCCAGTGTCACCAGATAGGTCTTCTCGCAATGATGGCGCGG  >  minE/1411487‑1411546

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑