Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1417946	1417952	7	56 [0]	[0] 50	proL/narP	tRNA‑Pro/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with NarQ or NarX

CATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCA  >  minE/1417953‑1418015 |                                                               cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACgcgc                             >  1:2688586/1‑36 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:3001836/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:10371/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2480107/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2489509/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2511845/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2615621/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2632728/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2738303/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2777245/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2917623/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2933494/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2995064/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2391712/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:3253542/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:3255762/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:3301924/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:3359024/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:3459791/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:422227/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:50555/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:511346/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:767192/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:835998/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:947443/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1488360/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1041790/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1073375/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1118005/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1122856/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1133328/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1238600/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1272264/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1279931/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:134180/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1349790/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1422923/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1602347/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1606516/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1674183/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1769066/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:178753/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:1799352/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2018748/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2128473/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2251101/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2281943/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAacgctacgct    >  1:2288976/1‑61 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACAAac            >  1:363623/1‑53 (MQ=255) cATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCT‑GTAGCGTTACCAACGCTACGCTCa  >  1:2356546/1‑62 (MQ=255) |                                                               CATGTCCATACATAAAATGGGGTAACATTCACGCGCCTGGTAGCGTTACCAACGCTACGCTCA  >  minE/1417953‑1418015

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑