Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1445914 1445932 19 11 [0] [0] 43 rcsC hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

TCTTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAT  >  minE/1445933‑1445993
|                                                            
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCTGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3144918/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGTTCAt  <  1:3491838/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:331491/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2639691/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2715269/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2741857/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2790375/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3016519/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3073188/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3164913/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3234831/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3292770/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2637225/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3342915/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3449679/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3457379/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:346716/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3467902/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:3586149/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:365213/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:425880/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:678997/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1957418/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1025224/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1083666/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1210524/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1412460/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1467368/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1722881/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:172381/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1726031/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1780835/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1876730/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:1014923/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2003071/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2037928/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2039214/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2124725/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2190660/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2301228/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2344153/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2436498/61‑1 (MQ=255)
tctTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAt  <  1:2556862/61‑1 (MQ=255)
|                                                            
TCTTTGGTTTGCAACAGATCCAGGTTACCGATAATGCCATACAGCGGCGTTCGCAGCTCAT  >  minE/1445933‑1445993

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: