Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1448834	1448873	40	2 [0]	[0] 40	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

TGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAATT  >  minE/1448874‑1448934 |                                                             tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACa                           >  1:922790/1‑36 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCaa             >  1:2521914/1‑50 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:3279187/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:2736445/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:2792222/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:283321/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:2913874/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:3022762/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:3058392/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:3120829/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:3128609/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:3199051/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:2715256/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:328726/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:362158/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:3648640/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:544909/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:586460/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:690420/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:904933/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:943311/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1736185/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1097948/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1114689/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1342555/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:144877/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1546014/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:163070/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1660538/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1705097/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:171326/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1076678/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1830617/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1864344/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:1942772/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:2022972/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:2034770/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:2161759/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:221712/1‑61 (MQ=255) tGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAAtt  >  1:2396877/1‑61 (MQ=255) |                                                             TGTCCGTAGTACTCAAAGAAATCGATTCAATTAACAAAGTTATTCAGCAATTGCTCGAATT  >  minE/1448874‑1448934

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑