Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1460614	1460633	20	31 [0]	[0] 99	yfaS yfaS	ECK2220:JW2222+JW2221:b4500; hypothetical protein ECK2220:JW2222:b2228; hypothetical protein, N‑ter fragment

CCACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGT  >  minE/1460634‑1460680 |                                               ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCaa       >  1:3081165/1‑42 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGActt  >  1:1126902/1‑45 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACga  >  1:2929085/1‑46 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACg   >  1:966902/1‑46 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACg   >  1:820376/1‑46 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACg   >  1:2704276/1‑46 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACg   >  1:140868/1‑46 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2880363/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3331349/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2960038/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:306339/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3132388/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3150264/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3194536/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3224380/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3251557/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2533250/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2870591/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2862091/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2833103/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:280737/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:270017/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:26634/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2635700/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2571725/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2558587/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2548967/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2500655/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:596255/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:940247/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:928161/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:886592/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:872619/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:869320/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:856276/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:839691/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:835159/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:834909/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:784261/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:609176/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3377295/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:502940/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:497593/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:460072/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:452650/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:442455/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:424709/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3603032/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3583238/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3564361/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:3417831/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1584934/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1789755/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1756516/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1746532/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1745134/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:171687/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1664645/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1627321/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1627035/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1599236/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1597348/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1588375/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1824848/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1579003/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:15679/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1528157/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1410977/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1316225/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1300131/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:129188/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1275520/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1260541/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1166037/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:105486/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2171926/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1044600/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2498991/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2498945/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2487530/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2454564/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2399312/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2342198/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2311137/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2256951/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2234569/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2218642/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2513108/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2127630/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2119807/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2094742/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2089991/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:2051819/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:195802/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1911449/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1898057/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:186073/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:1830743/1‑47 (MQ=255) ccACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGt  >  1:182700/1‑47 (MQ=255) |                                               CCACGCGAAAACTGCTGCTATAGACCTGATTGCGGTAAGCAAGACGT  >  minE/1460634‑1460680

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑