Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1461511	1461514	4	9 [0]	[0] 34	yfaS yfaS	ECK2220:JW2222+JW2221:b4500; hypothetical protein ECK2220:JW2222:b2228; hypothetical protein, N‑ter fragment

GTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTATT  >  minE/1461515‑1461576 |                                                              gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATccc                     >  1:1436678/1‑43 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATc                       >  1:2159953/1‑41 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:3398189/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2670396/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2719507/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2773253/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2958932/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2977610/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:319879/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:3323452/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2558757/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:3415827/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:364317/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:449104/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:458856/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:465227/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:478047/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2384449/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1184996/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1211843/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1281420/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:132035/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1436837/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1474727/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1624069/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1780088/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1921277/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:206851/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2233886/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2292114/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:2297434/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:1049167/1‑62 (MQ=255) gTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCACACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:3616916/1‑62 (MQ=255) gTACGCTCCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTAtt  >  1:3342149/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTACGCTGCATCACGCGGCGAGATTTGCCGTACCAGTTATCCCACAGCCAGGTTAGCGTATT  >  minE/1461515‑1461576

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑