Missing coverage evidence...
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ACGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACT  >  minE/1468309‑1468369 |                                                             aCGCCCTGATAAATCACCTTCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:1188162/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGccc             >  1:1668826/1‑50 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:422151/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:1148414/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3633325/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3631218/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3563361/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3427702/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3370744/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3083372/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3067572/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3058611/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:3049185/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:2546080/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:251030/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:2427358/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:2357380/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:1884078/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:1789527/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:1601633/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:1537927/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACt  >  1:1438328/1‑61 (MQ=255) aCGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCAGTAACCACt  >  1:2828194/1‑61 (MQ=255) |                                                             ACGCCCTGATAAATCACCTGCGCCTGCGGTTCAATCACCACACCACGCCCCGGTAACCACT  >  minE/1468309‑1468369

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑