Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1476977	1476983	7	53 [0]	[0] 39	inaA	conserved hypothetical protein

CACCAGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCATTTT  >  minE/1476984‑1477044 |                                                             caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAATCTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:210707/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:3551662/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:2899617/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:2950728/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:2976623/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:3023752/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:3131872/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:3230971/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:3417297/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:354022/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:2821801/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:3568475/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:3602298/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:3606227/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:383633/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:603922/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:613842/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:621407/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:651647/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:906323/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1778398/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1250383/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1318592/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1363413/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1364655/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1460197/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1501501/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1587554/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1627930/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1685674/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:2862298/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1793038/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1821317/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1835443/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1928237/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:2301562/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:2304339/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:2516284/61‑1 (MQ=255) caccaGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCAtttt  <  1:1093053/61‑1 (MQ=255) |                                                             CACCAGTGATTAAATTCGTCGTACTTTGCTGAAACTGCCATACCCTATCGCCTGTCATTTT  >  minE/1476984‑1477044

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑