Missing coverage evidence...
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CGACTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCCG  >  minE/1485196‑1485257 |                                                              cgacTGGCCGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:418345/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGATTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:557519/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTg                        >  1:839058/1‑40 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCTGTTGCCcg  >  1:1581426/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGccc   >  1:2204489/1‑61 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGccc   >  1:3273562/1‑61 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGccc   >  1:1760810/1‑61 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGccc   >  1:2893167/1‑61 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGccc   >  1:2695899/1‑61 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGccc   >  1:878024/1‑61 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGccc   >  1:1134865/1‑61 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2674871/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2736505/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2962420/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:299172/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:3151158/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2383910/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:3383332/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:3459159/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:3498163/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:44370/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:619337/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:647822/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:672882/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:727075/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:940344/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1972010/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1096603/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1152408/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:120107/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1201455/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1268357/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1288554/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1507138/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1635072/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1796473/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1957536/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1993263/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2123534/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2130654/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2173430/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2189574/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2193592/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2215249/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2323463/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:1000112/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCcg  >  1:2495087/1‑62 (MQ=255) cgacTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCCAAATGCAGGTCAGTAGCCcg  >  1:2611428/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGACTGGCAGCCATCATCGCCGCCGCGTTGACCGGACTTGCGAAATGCAGGTCAGTTGCCCG  >  minE/1485196‑1485257

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑