Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1493553	1493579	27	25 [0]	[0] 46	nuoG	NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain G

CGCGTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGC  >  minE/1493580‑1493641 |                                                              cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3479873/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1065740/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2707246/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2914067/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2948643/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3004268/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3105579/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3162888/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3235694/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3244259/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3266316/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3297900/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2452118/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:437738/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:483672/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:600452/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:604022/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:683011/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:751247/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:869676/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:919907/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:978785/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:990965/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2333921/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1143907/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:128246/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1339196/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1346768/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1374518/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1407034/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1430787/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1464115/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1530889/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1548473/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1561289/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1607027/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1733693/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:1833581/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2145018/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2203271/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2217874/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2276952/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2293091/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2307119/62‑1 (MQ=255) cgcgTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:2382315/62‑1 (MQ=255) cgcgGGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGc  <  1:3459260/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGCGTGTACCTGCGTTCACACCCAACTTCGCGGCATCCGCTGGGTTGAGTTTGATGTACGGC  >  minE/1493580‑1493641

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑