Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1527484	1527484	1	32 [0]	[0] 73	trmC	fused 5‑methylaminomethyl‑2‑thiouridine forming enzyme methyltransferase and FAD‑dependent demodification enzyme

TTAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCA  >  minE/1527485‑1527524 |                                        ttAACGAACTTACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:533000/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGAGGATTCGCTAAATCa  <  1:923604/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3366291/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3595908/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3591614/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3590310/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:356808/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3493562/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3475645/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3429610/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3406998/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3633871/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3255392/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3214718/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3142280/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3032686/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3011305/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2751341/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2748077/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2725463/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:749050/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:995421/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:977439/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:967584/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:939833/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:922261/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:909941/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:8151/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:753600/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:3601145/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:680486/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:655934/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:651122/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:487242/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:484413/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:470660/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2721226/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:147895/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1001946/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1851646/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1709507/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1659568/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1652455/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1582964/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1554602/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1514411/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1854731/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:135290/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1282540/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1260584/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1182297/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1128727/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:108146/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1081201/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1018818/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2499247/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2678738/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2670717/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2646089/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2590770/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2589954/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2576522/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2551055/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1919118/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2425367/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2423653/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2276848/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2251036/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2112946/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:2050485/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCa  <  1:1968588/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCCAAATCa  <  1:2233121/40‑1 (MQ=255) ttAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATCCGCTAAATCa  <  1:1022820/40‑1 (MQ=255) |                                        TTAACGAACTGACCAGCCAACTGGACGATTCGCTAAATCA  >  minE/1527485‑1527524

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑