Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1535933 1535934 2 33 [0] [0] 97 yfcQ predicted fimbrial‑like adhesin protein

CTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGT  >  minE/1535935‑1535973
|                                      
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATATCAAGCGGAg   >  1:2167327/1‑38 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCATGCGGAGt  >  1:1995330/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCATGCGGAGt  >  1:1999409/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAg   >  1:2666022/1‑38 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAg   >  1:1152542/1‑38 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAg   >  1:3358619/1‑38 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAg   >  1:1267058/1‑38 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAg   >  1:459652/1‑38 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAg   >  1:532441/1‑38 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3033032/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3403504/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3359868/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3340778/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3307326/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3300424/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3164410/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3086106/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3045417/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3607941/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3026415/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3009162/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2866181/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2819812/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2688663/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2682286/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2647892/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2638144/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2574692/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:628101/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:955832/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:898506/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:879293/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:795575/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:768887/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:681164/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:671820/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:657170/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:653374/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:648781/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:646867/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3462625/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:615676/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:570716/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:552517/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:496051/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:423237/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:416079/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:415569/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3627897/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2449308/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:3597772/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1338038/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1914557/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1801421/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1766459/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1707504/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1681426/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1659458/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1616014/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1464257/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1462933/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1407761/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1383013/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1928950/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1313837/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1283224/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1250926/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1199169/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:117064/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1145829/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1115911/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1097493/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1056929/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1018137/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2142671/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2514302/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2489204/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1018072/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2403736/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2330926/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:229729/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2225978/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2220035/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2210608/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2192978/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2156599/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2543635/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:214065/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2117968/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2093982/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:204855/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2047539/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2045378/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:2029949/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1980357/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1969994/1‑39 (MQ=255)
cTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGt  >  1:1941825/1‑39 (MQ=255)
|                                      
CTTTTGCGTAAAATCAGTGGCGTTGATAGCAAGCGGAGT  >  minE/1535935‑1535973

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: