Missing coverage evidence...
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GATAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCG  >  minE/1547641‑1547702 |                                                              gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:3621865/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2729890/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2927502/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:3058075/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:3125647/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:3185593/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:3461804/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:3506727/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:3552134/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2680292/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:3639478/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:452799/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:619093/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:808679/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:837169/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:839346/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:840909/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:1131203/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2674410/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2668138/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2636055/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2630502/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2608866/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2563889/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2505280/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2493745/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2411222/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2303796/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2211322/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:2001605/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:1872134/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:1450225/62‑1 (MQ=255) gatAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCg  <  1:1212392/62‑1 (MQ=255) |                                                              GATAACTGGACCTTCCGTACCGGTATCGCCTTTGATGACAGCCCAGTTCCTGCACAGAATCG  >  minE/1547641‑1547702

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑