Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1557575	1557581	7	2 [0]	[0] 28	emrY	predicted multidrug efflux system

ACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGT  >  minE/1557582‑1557643 |                                                              aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:3114636/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:923040/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:908/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:885591/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:847153/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:810046/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:756434/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:590958/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:509895/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:497300/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:443120/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:3571903/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:3432139/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:3293026/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:1021643/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:2918477/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:261760/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:22678/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:2030584/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:1992842/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:1771440/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:1734573/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:1581308/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:1303521/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:1289705/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:1069177/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGACAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:2170570/62‑1 (MQ=255) aCAGGGATCGAAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGt  <  1:3051456/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACAGGGATCGCAATGGCATTTGCTACACCAAACGAGGTGATAACCCAGGTGCCTTCGTCTGT  >  minE/1557582‑1557643

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑