Missing coverage evidence...
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CGGAAATGGTCTGGCTGGCAGCGACCCGAACTTTTCCGCTCAGTTGTTGCCCCATACGCCCG  >  minE/1579602‑1579663 |                                                              cgGTAATGGTCTGGCTGGCAGCGACCCGAACTTTTCCGCTCAGTTGTTGCCCCATACGccc   >  1:2409468/1‑61 (MQ=255) cgGAAATGGTCTTGCTGGCAGCGACCCGAACTTTTCCGCTCAGTTGTTGCCCCATACGccc   >  1:685462/1‑61 (MQ=255) cgGAAATGGTCTGGCTGGCAGCGCCCCGAACTTTTCCGCTCAgttgt                 >  1:985532/1‑47 (MQ=255) cgGAAATGGTCTGGCTGGCAGCGCCCCGAACTTTTCCGCTCAGTTGTTGCCCCATACGccc   >  1:2802310/1‑61 (MQ=255) cgGAAATGGTCTGGCTGGCAGCGACCCGATCTTTTCCGCTCAGTTGTTGCCCCATACGccc   >  1:1152616/1‑61 (MQ=255) cgGAAATGGTCTGGCTGGCAGCGACCCGAACTTTTCCGCTCAGttgttg               >  1:2703516/1‑49 (MQ=255) cgGAAATGGTCTGGCTGGCAGCGACCCGAACTTTTCCGCTCAGTTGTTGCCCTATACGccc   >  1:2132607/1‑61 (MQ=255) cgGAAATGGTCTGGCTGGCAGCGACCCGAACTTTTCCGCTCAGTTGTTGCCCGATACGccc   >  1:338809/1‑61 (MQ=255) cgGAAATGGTCTGGCTGGCAGCGACCCGAACTTTTCCGCTCAGTTGTTGCCCCATACGccc   >  1:2254846/1‑61 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑