Missing coverage evidence...
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AAATATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGCC  >  minE/1599205‑1599264 |                                                            aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:3611035/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2841757/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2856480/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2913568/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2966152/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2987678/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:3001711/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:3015204/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:3381032/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2809791/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:3641020/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:535969/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:697012/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:708049/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:761305/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:842365/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:912832/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:919548/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2801007/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1055741/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1139422/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1180937/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1197144/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1215240/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1287715/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1396343/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1551377/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1766247/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1905649/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1927671/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:211414/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2602655/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2724197/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:2745478/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1050705/60‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTAGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGcc  <  1:1601844/60‑1 (MQ=255) |                                                            AAATATTAATTTAACGGCACAGGATGTGGTGGTTGGCATTGCTGCCAGCGGTCGCACGCC  >  minE/1599205‑1599264

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑