Missing coverage evidence...
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CCGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAACCAC  >  minE/1604426‑1604487 |                                                              ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3548860/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:103789/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3226684/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3283199/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3308832/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3381490/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3440201/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3458146/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3460701/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3466713/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3501338/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3199786/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3577772/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:444614/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:516026/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:612431/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:615802/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:629617/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:701043/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:777669/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:79525/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:885165/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1694382/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1103240/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1220779/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:124554/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1245603/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:130543/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1567654/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1611587/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1618553/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1648054/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:3016745/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1832218/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1842076/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:1875457/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:2094533/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:224185/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:2580391/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:2623414/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:2758854/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:2769035/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:2933408/62‑1 (MQ=255) ccGATACCGCTAACGGAATCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAaccac  <  1:418770/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCGATACCGCTAACGGATTCACCGTTCAGCCACAGCCACGGTTGCCAGCAAAGTAAAACCAC  >  minE/1604426‑1604487

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑