Missing coverage evidence...
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CGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGAT  >  minE/1627876‑1627922 |                                               cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:3279860/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1081451/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2324599/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2403521/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2502951/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2629781/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2809379/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:302117/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:3073270/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2256636/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:3627600/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:3633179/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:413953/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:44275/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:451989/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:454130/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:495125/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:536047/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1691759/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1114634/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1342726/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1382468/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1476142/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:154963/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:160519/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1610836/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2244046/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1732869/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1803917/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:186017/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1864088/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:1889906/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:207091/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2137727/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccggat  >  1:2164879/1‑47 (MQ=255) cgcATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGtgattgccgga   >  1:529834/1‑46 (MQ=255) |                                               CGCATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGAT  >  minE/1627876‑1627922

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑