Missing coverage evidence...
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GCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAGCGC  >  minE/1647640‑1647700 |                                                             gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:113949/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:1175570/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:1227969/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:1430276/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:1565241/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:1849201/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:2104515/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:2457359/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:2619611/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:2936272/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:312733/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:3193603/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:361518/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:40548/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:454930/1‑61 (MQ=255) gCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAgcgc  >  1:746269/1‑61 (MQ=255) |                                                             GCGGATGCAGGTTAACCGCTTCGGAGAACAACACCGGCACTAACAGGTTGCCGTCCAGCGC  >  minE/1647640‑1647700

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑