Missing coverage evidence...
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GTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCGG  >  minE/1653883‑1653920 |                                      gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:466749/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2731228/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2867511/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:3069175/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:3124033/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:3223398/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:3349952/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:3416261/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:409762/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:427942/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2716188/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:496511/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:610856/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:627618/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:690083/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:715383/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:71749/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:916500/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:925779/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:989026/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1645067/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1115025/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1166568/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1172708/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1336806/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1465138/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1485333/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1560936/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1595668/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1622058/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1063525/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1670967/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:1907300/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2149120/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2190656/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2199025/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2237033/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2342131/38‑1 (MQ=255) gTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCgg  <  1:2433344/38‑1 (MQ=255) |                                      GTGACCGATAAAACCTCTCTTAGCTACAAAGATGCCGG  >  minE/1653883‑1653920

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑