Missing coverage evidence...
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GCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCA  >  minE/1721970‑1722031 |                                                              gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:377478/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1002652/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:2509622/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:2753889/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:2852186/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:306886/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:3280612/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:3384625/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:3605764/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:2302213/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:481702/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:48956/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:730134/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:73772/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:751359/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:911719/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:95428/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1722561/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1026317/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1101908/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1192840/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1228595/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1441058/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1479168/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:166876/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:2296725/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1833981/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1882656/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1967753/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:1979621/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:2046990/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:221274/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGACGCTACATTCa  <  1:1670137/62‑1 (MQ=255) gCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGAATTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCa  <  1:2580744/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCCAGTAAAGCGGATTGGTTTCGGTTGATTTACCTTGCAGCGCCCAGATGTCGCTACATTCA  >  minE/1721970‑1722031

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑