Missing coverage evidence...
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CCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCG  >  minE/1737063‑1737124 |                                                              ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCg                       >  1:2754583/1‑41 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGtt                     >  1:3044134/1‑43 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGt                      >  1:2779959/1‑42 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGAtt    >  1:891013/1‑60 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:2991235/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:998442/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:97743/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:642870/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:559285/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:3524397/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:3401522/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:3397388/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:3382816/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:3220300/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:3109044/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:1034899/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:2892103/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:2697939/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:2599060/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:2382796/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:2290549/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:2289618/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:2117447/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:1812292/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg  >  1:1744366/1‑62 (MQ=255) ccATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGACGTTGCCCGACCGACCAGAtt    >  1:1854597/1‑60 (MQ=255) |                                                              CCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCG  >  minE/1737063‑1737124

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑