Missing coverage evidence...
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GTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCAAA  >  minE/1741453‑1741514 |                                                              gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3190406/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1079281/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2714274/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2736540/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2791496/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2879130/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3090588/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3170968/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3188894/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2576643/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3241909/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3327217/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3442107/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3469301/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:3521959/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:891799/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:911435/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:187088/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1177908/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1229799/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1269456/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1473133/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1601728/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1681974/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1807276/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:248145/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1961030/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:1972518/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2056817/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2156146/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2220459/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2299310/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2388159/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaaa  >  1:2411211/1‑62 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCaa   >  1:634805/1‑61 (MQ=255) gTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGAGCCTGCTCaa   >  1:3548589/1‑61 (MQ=255) |                                                              GTTCCTAAAGTTTGAATTCCTGGCACCTGTACAGCGGCTTGCTGGGTTTGCGCCTGCTCAAA  >  minE/1741453‑1741514

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑