Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1742735	1742748	14	68 [0]	[0] 85	rpoE/nadB	RNA polymerase, sigma 24 (sigma E) factor/quinolinate synthase, L‑aspartate oxidase (B protein) subunit

CTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGT  >  minE/1742749‑1742810 |                                                              cTCCATTATCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3167146/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCGATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2908250/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTagag                          >  1:2090766/1‑38 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTaga                           >  1:2798738/1‑37 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTag                            >  1:1357887/1‑36 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGtt                 >  1:287496/1‑47 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTg             >  1:183175/1‑51 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTcc    >  1:2020048/1‑60 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTcc    >  1:653643/1‑60 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCg   >  1:1605246/1‑61 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCg   >  1:3023956/1‑61 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCg   >  1:2225264/1‑61 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3017522/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3317990/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3310663/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:323369/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:320586/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:858257/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3044657/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:770919/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3019983/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3334163/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2996021/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2993287/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:877037/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2903554/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:943135/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2807861/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:988980/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:612399/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:787716/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3354112/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3451698/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3487720/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:814213/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2688181/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3501913/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3543871/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:356828/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3574108/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:3618167/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:443559/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:803728/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:509604/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:561512/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1643720/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2794085/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2019066/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2003319/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1922690/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1884801/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1882882/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1851434/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1718222/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1701233/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2093058/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1620733/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1577773/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1575050/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1438346/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1413322/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1271102/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1254158/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1127771/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1114849/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2506153/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2766950/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2713499/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:1089789/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2651595/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2638488/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2610075/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2538466/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2513414/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2135149/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2450689/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2433925/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2417711/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2405585/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2393748/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:229622/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2291317/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2239979/1‑62 (MQ=255) cTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGt  >  1:2141050/1‑62 (MQ=255) cTCAATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCg   >  1:733957/1‑61 (MQ=255) |                                                              CTCCATTAGCTGCAATTTGAGCAAGCAAAGGGTTAGAGTGTCTCGTTTTTGTAAAGTTCCGT  >  minE/1742749‑1742810

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑