Missing coverage evidence...
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CTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCA  >  minE/1747348‑1747393 |                                              cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3258174/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2778113/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2779616/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2855037/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2896648/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2981740/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3085466/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3176098/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3183077/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3246836/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2746716/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3261394/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3356166/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3433084/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3480871/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3572283/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:3616329/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:486111/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:602235/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:77044/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1827979/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1143209/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1147095/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1384700/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1427904/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1589512/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1597462/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1654195/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1694014/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1806137/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1028084/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1946464/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1958065/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2053588/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2187195/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2556976/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:255977/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2582175/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:2620825/46‑1 (MQ=255) cTTATAAGCTCAATGGTGTTTACCACCGTGATCCGCCGCTGACGCa  <  1:1875494/46‑1 (MQ=255) |                                              CTTATAAGCTCAATGGTGTTTTCCACCGTGATCCGCCGCTGACGCA  >  minE/1747348‑1747393

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑