Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1768125	1768149	25	22 [0]	[0] 86	rluD	23S rRNA pseudouridine synthase

CCACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTG  >  minE/1768150‑1768211 |                                                              ccACCTGCGGTCATATGACCAATGGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:473097/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2863078/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3435499/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3402664/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3367463/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3366960/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3316590/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3258171/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3230829/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3182936/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3059050/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3443005/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2846548/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2819938/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2801565/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2775212/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2749652/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2706483/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2664784/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2541788/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2535342/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2526041/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:497940/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:967592/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:882386/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:843078/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:812655/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:811469/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:767724/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:756134/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:737933/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:733022/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:580725/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3437389/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:428433/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:373844/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3642572/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3636583/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3621876/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3614929/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3578274/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:3562903/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2511376/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1394405/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1684496/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1678459/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1656631/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1646395/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1623337/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:155503/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1538217/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1523609/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1490409/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1412783/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1750133/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1392719/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1323001/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1319790/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1272825/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1258378/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1205773/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1152706/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1055407/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1009393/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1003236/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1999932/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:243903/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2431142/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2398518/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2368797/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2319463/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2318126/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2279645/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2131099/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2122426/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:2061243/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1001060/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1963718/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1889099/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:188828/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1858029/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:184802/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1846289/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1806151/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:178073/62‑1 (MQ=255) ccACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTg  <  1:1763177/62‑1 (MQ=255) |                                                              CCACCTGCGGTCATATGACCAATCGCCACCGCTTCATACTCACGAGTAATTTCACGCCGTTG  >  minE/1768150‑1768211

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑