Missing coverage evidence...
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GGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAC  >  minE/1801786‑1801847 |                                                              ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGa   >  1:3165707/1‑61 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:369898/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:3075739/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:3166185/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:3354/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:3403302/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:3411895/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:3447186/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:3540446/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:3629442/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:2883676/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:44314/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:58922/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:612012/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:61472/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:835534/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:942480/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:953571/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:959123/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1800810/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1415386/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1467227/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1491840/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1492146/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:150912/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1627517/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1662035/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1668451/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1758282/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:1180545/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:2038872/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:2158027/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:2531484/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:2701523/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:2733291/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:277506/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:2785596/1‑62 (MQ=255) ggTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAc  >  1:2882728/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGTACGGCATTAACCGGTTTATTCTCAGTCGTGGCACAAATTCTGGTTCCGCTGGCAGCGAC  >  minE/1801786‑1801847

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑