Missing coverage evidence...
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GGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGG  >  minE/1801944‑1802005 |                                                              ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:1226853/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:134712/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:1549276/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:1801875/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:1995925/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:2190324/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:2335515/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:2531413/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:2945296/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:3390523/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:607282/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:804209/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATgg  <  1:867392/62‑1 (MQ=255) ggCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGGGTTAATGGCACTGATgg  <  1:1590958/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGCGAATCTCGGCGGCTGGCGCACCGTCTTTTGGGTTGCTTCGGTGTTAATGGCACTGATGG  >  minE/1801944‑1802005

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑