Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1807717	1807906	190	32 [0]	[0] 89	[luxS]	[luxS]

CTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTATAT  >  minE/1807907‑1807966 |                                                            cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACtctttctt                       >  1:3391687/1‑39 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTGTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:826152/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCTCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2857866/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCg               >  1:2416792/1‑47 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:3256870/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:208429/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2141047/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2190740/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:219731/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2254973/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2558027/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2562831/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2672747/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:286243/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2930082/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:279110/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:3372655/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:3532097/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:3567255/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:3571454/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:374261/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:598112/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:707177/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:737840/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:977483/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2049722/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:1389650/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:1450520/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:2011826/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:1628751/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:138915/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:1136519/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:1372848/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:118275/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:1792419/1‑59 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:543975/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3488092/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:481895/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1161248/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3639265/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3632549/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3580271/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3521746/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3510491/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1109855/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:58794/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1157245/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:617919/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:636133/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:652359/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:655984/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:684921/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1148061/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:802825/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:820077/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1127707/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:847135/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:925586/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2084123/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2175739/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1982471/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:225717/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2338428/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2351830/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:181384/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2429315/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2474525/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1799732/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2594762/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2752796/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1989806/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1056120/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2172880/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2136592/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1567295/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1552469/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:2995820/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3000135/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3009387/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3116268/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:314487/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3201854/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1478186/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:3452560/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGAatat  >  1:3263485/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCAGAGTatat  >  1:512131/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCACAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:1615563/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACGCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTatat  >  1:579791/1‑60 (MQ=255) cTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCAGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGtata   >  1:595524/1‑59 (MQ=255) |                                                            CTCCGGTAATTTTTTTAAAAATTTTCTGAACTCTTTCTTCCCAGGCGAGTCTGAGTATAT  >  minE/1807907‑1807966

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑